本发明提供了一种红斑丹毒丝菌亚单位疫苗及制备方法及应用,本发明提供的亚单位疫苗包含SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列,该序列不同于任何已公开的相关序列,将该蛋白对应的核苷酸序列克隆至大肠杆菌,获得了一株可表达spaA蛋白的基因工程菌:大肠杆菌(Escherichia coli)BL21/pET‑28a‑spaA,保藏编号为CCTCC NO:M2015076。该基因工程菌蛋白表达量高,操作简单,适于大规模的亚单位疫苗的生产。制备出的疫苗对机体产生的抗体水平高,持续性长,具备安全性和稳定性,是一种极具开发潜力的红斑丹毒丝菌亚单位疫苗。