本发明公开了一种多靶点重组基因及其蛋白在防治幽门螺旋杆菌感染中的应用。包括具有SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的多靶点融合多肽、具有SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的编码多靶点融合多肽的多靶点重组基因、以及上述多靶点重组基因或上述多靶点融合多肽或上述多靶点融合多肽的特异性抗体作为生物制品在预防和治疗幽门螺旋杆菌感染中的应用。本发明对Hp胃内定值关键靶蛋白UreI及UreB的抗原靶点进行有效整合,创造出最佳药物靶点。通过生物信息学的方法对UreI及UreB的表位进行预测获得的多靶点融合多肽不仅对Hp发病机制研究,而且对Hp预防和治疗制剂的研究均有重要意义。获得的多靶点融合多肽疫苗、核酸疫苗、抗体制品在体外实验和动物体内实验中显示了良好的防治幽门螺旋杆菌感染的特性,该发明具有良好的应用前景。